Genomikus könyvtár vs. cDNA könyvtár
Tartalom
- Tartalom: A Genomic Library és a cDNA Library közötti különbség
- Összehasonlító táblázat
- Mi a genomi könyvtár?
- Mi a cDNA könyvtár?
- Főbb különbségek
A genomiális könyvtárat és a cDNS könyvtárat egyaránt használják génklónozásban a különféle DNS-ek izolálására. A két könyvtár közötti különbség az, hogy a genomkönyvtár olyan DNS-fragmenseket tartalmaz, amelyek egy szervezet teljes genomját expresszálják, míg a cDNS könyvtárban az mRNS-t egy szervezet adott sejtjeiből veszik, majd a cDNS egy mRNS-ből áll egy reakcióban, amelyet katalizálnak enzim által.
Tartalom: A Genomic Library és a cDNA Library közötti különbség
- Összehasonlító táblázat
- Mi a genomi könyvtár?
- Mi a cDNA könyvtár?
- Főbb különbségek
Összehasonlító táblázat
bázis | Genomikai Könyvtár | cDNA könyvtár |
Meghatározás | A genomi könyvtár az egyik organizmus teljes genomi DNS-gyűjteménye. A DNS-t hasonló vektorok populációjában tárolják, amelyek mindegyike különálló DNS-inszertet tartalmaz. | A cDNS könyvtár egy klónozott cDNS fragmens keveréke, amelyet beépítünk egy gazdasejt-szelekcióba, amely együttesen a szervezet transzkriptómájának részét képezi. |
Kifejezés | Teljes genom | Csak specifikus gének. |
Méret | nagyobb | Kisebb |
intronokat | Jelenlegi | Hiányzó |
Vektor | Nagy plazmidok elhelyezésére plazmidokat, kozmidot, lambda fágot, YAC-t és BAC-t használ. | Nincs intron, ezért plazmidokat, fagemidokat és lambda fágot használ a szerény fragmensek elhelyezésére. |
Mi a genomi könyvtár?
A génklónozási eljárás során a kérdéses gént a szervezetből elválasztott DNS-ből lemásolják. Amikor a DNS-t elválasztják egy organizmustól, annak géneit egyszerre extrahálták. A szervezet DNS-e több ezer különböző gént tartalmaz. A géntechnikus egy olyan specifikus gént talál, amely az érdeklődő fehérjét kódolja.
Egyáltalán nincs olyan módszer, amellyel egy adott gén a DNS-ből elérhető, ezért a tudósok génkönyvtárakat készítenek a szervezet DNS-ének katalogizálására. A tudósok, majd válasszák ki a kívánt gént a könyvtárban. A génkönyvtár egy élő baktériumcsalád olyan csoportja, amelyet egyedülálló DNS-darabokkal átalakítottak a szervezetben, amely a kívánt gén eredete. A DNS-t egy organizmusból extrahálják egy könyvtár létrehozása céljából, amely a DNS szervezett formája. A genomi könyvtár és a cDNS kétféle gén könyvtár. Számos génklónozási technikát használtunk génstratégiának a rekombináns technológiában.
A DNS-fragmenseket elválasztjuk úgy, hogy specifikus restrikciós enzimekkel elvágjuk a szülő DNS-től. Ezeket a fragmentumokat vektormolekulákhoz ligáljuk, és a felhalmozódott molekulákat a gazdasejtekbe helyezzük, minden sejtben 1 molekulát. A genomi könyvtár intronokból, szemét DNS-ből és számos más fragmentumból áll. Ezen a könyvtáron belül a DNS a sejt belsejében kisebb fragmensekre oszlik. Ezt követően az összes apró részt beillesztik egy vektorba könyvtár létrehozása céljából. A genomi könyvtár a teljes gén összes DNS-ét tartalmazza, a sejt pedig az összes intront tartalmazza. A genomi DNS a teljes genom transzlációja. Az intronok mérete miatt nem kódolja a teljes részt egy kodonon. A genomi könyvtárban nincs olyan illesztési mechanizmus, amely megnehezítené a könyvtárból vett gének kifejezését.
Mi a cDNA könyvtár?
A cDNS könyvtárat egy szövet- vagy sejttípus kiválasztásával állítják elő. Ezt követően mRNS-t izolálunk a szövetből vagy a sejtből. Az mRNS-molekula DNS-másolata specifikus enzim reverz transzkriptáz enzimből áll. Tehát a cDNS könyvtár azt a specifikus DNS-t tartalmazza, amely jelen van az mRNS-ben. Ebben a könyvtárban nem található intron és DNS-szekvencia. Ezen a könyvtáron belül az összes klón teljes hosszúságú. Ezenkívül egy cDNS-klón elengedhetetlen a sejtek transzfektálásához fehérjetermeléshez vagy sejt-alapú vizsgálatokhoz.
Főbb különbségek
- A genomi könyvtárat közvetlenül a genomi DNS-ből írták.
- A cDNS könyvtárat úgy alakítottuk ki, hogy templátként mRNS-t használtunk.
- A genomkönyvtár e szervezet teljes genomját foglalja el.
- A cDNS könyvtár csak bizonyos betegségek géneit képviseli.
- Két enzim, restrikciós endonukleázok és ligázok fontosak a genomiális könyvtár felépítéséhez.
- A reverz transzkriptáz enzim jelentős szerepet játszik a cDNS könyvtár felépítésében.
- A genomkönyvtár mind a prokarióta, mind az eukarióta organizmusok DNS-ét elfoglalja.
- A cDNS könyvtár csak az eukarióta organizmusok DNS-ét képviseli.
- A cDNS könyvtár képes genom expresszióra prokarióta baktériumokban, mivel nincsenek intronok.
- A genomiális könyvtár nem képes megmondani a prokarióta organizmusban, mivel intronok vannak, és a prokarióta organizmusnak nincs gépe az intronok feldolgozására.